La historia comienza con una redada contra el contrabando en la que el magistrado Maskew asesina a sangre fría al joven hijo de Elzevir Block.
Cuando llegan los contrabandistas, John se oculta pero logra reconocer las voces de Ratsey y Elzevir, quienes le dejan encerrado sin querer en la cripta.
Finalmente, es rescatado pero su tía se enfada y le echa de casa, siendo acogido por Elzevir como si fuera su hijo.
Tras diez años de trabajos forzados, John y Elzevir son embarcados con destino a Java para seguir allí su condena.
Años más tarde, sus hijos se marchan del pueblo pero John y Grace no abandonan jamás su amado Moonfleet.