Dos hermanos cazadores abrieron un claro de bosque y establecieron el primer asentamiento.
En 1565 el rey Segismundo II Augusto Jagellón otorgó los derechos para que el pueblo se convirtiera en ciudad.
El peor de ellos ocurrió en el año 1759 dejando a la ciudad completamente en ruinas.
En ese entonces, el Ejército Austrohúngaro repelió el avance Ruso suroccidental entre Limanowa y Cracovia.
Durante la Segunda Guerra Mundial, Limanowa fue invadida por soldados alemanes que se encargaron también de establecer un gueto.