[2]​ Se encuentra en la confluencia de los ríos Clearwater y Snake, que la separa del estado de Washington.

Lewiston se encuentra ubicada en las coordenadas 46°24′1″N 117°0′4″O / 46.40028, -117.00111.

Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, Lewiston tiene una superficie total de 46.73 km², de la cual 44.63 km² corresponden a tierra firme y (4.49%) 2.1 km² es agua.

[4]​ Según el censo de 2010,[6]​ había 31894 personas residiendo en Lewiston.

De los 31894 habitantes, Lewiston estaba compuesto por el 0.09% blancos, el 0.33% eran afroamericanos, el 1.74% eran amerindios, el 0.8% eran asiáticos, el 0.09% eran isleños del Pacífico, el 0.74% eran de otras razas y el 2.41% pertenecían a dos o más razas.