Esta laguna da su nombre a la región conocida como la Comarca Lagunera o simplemente "La Laguna", que comprende los municipios de Torreón, Gómez Palacio, Lerdo y poblaciones aledañas.
No fue hasta la segunda mitad del siglo veinte que se construyeron las presas "Lázaro Cárdenas" (El Palmito) y "Francisco Zarco" (Las Tórtolas), ambas en territorio duranguense, lo que sumado a la canalización que inicia en Ciudad Lerdo Durango, provocó la desaparición de la laguna y su ecosistema además de disminuir la recarga de los mantos acuíferos.
Este caso es muy similar a lo sucedido en el sistema lacustre del mar Aral pues los ríos que lo alimentaban el Amu Darya y el Syr Darya fueron desviados durante los años sesenta como parte de los proyectos agrícolas de la Unión Soviética.
Desde la construcción de las presas y la canalización del agua, la Laguna de Mayrán se ha convertido en un desierto y sólo ocasionalmente ha tenido agua, producto del drenaje de agua excedente que se capta en las presas Lázaro Cárdenas y Francisco Zarco.
En 2016 nuevamente el agua del Río Nazas corrió por su cauce desembocando en la Laguna de Mayrán.