Masur se casó tres veces y tuvo un total de cinco hijos.

[2]​ Él y su segunda esposa, Irmgard Elsa Kaul, tuvieron una hija, Carolin Masur, que se convirtió en cantante de ópera.

[3]​ En 1975, se casó con su tercera esposa, soprano y violista, Tomoko Sakurai con la que tuvo un hijo, Ken-David, cantante y director de orquesta clásico.

La opinión general es que Masur mejoró la interpretación de la orquesta en comparación con su predecesor.

Según se programó ya entonces, renunció a su cargo en el año 2008 en favor de Daniele Gatti.

[10]​ Durante años, Masur fue un defensor del régimen comunista de Erich Honecker.

En 2001, Masur se convirtió en miembro honorario de la Royal Academy of Music.

Masur también realizó grabaciones de Bach, Brahms, Britten, Bruch, Cerha, Debussy, Mahler, Shostakóvich, Schubert, Schumann y Sibelius, así como de Gershwin, cuyas obras publicó en vinilo en 1975.