[1]​ Khalid comenzó jugando en el North High School en Minneapolis, donde obtuvo cuatro títulos estatales consecutivos.

El-Amin lideró a los Huskies en anotación (16 puntos por partido), asistencias (4.4) y robos (1.7), para ser nombrado en el Mejor Quinteto de la Big East.

Connecticut acabó eliminado en 2ª ronda frente a Tennessee Volunteers con El-Amin lesionado con un esguince de tobillo.

Su entrenador, Jim Calhoun, se refería a él con frecuencia como "más talentoso que Richard Hamilton".

El-Amin dejó UConn con los siguientes logros: cuarto mejor porcentaje en tiros libres de su historia con 82.2%, sexto en asistencias y quinto en robos.

Sus promedios durante su carrera en la NCAA fueron de 16 puntos, 3.1 rebotes, 5.2 asistencias y 1.7 robos en 30.1 minutos.

Con el equipo hebreo llegó a semifinales de la Copa y promedió casi 20 puntos por partido.