Munroe ha realizado una amplia labor en animación durante la última década, incluyendo videojuegos, series de televisión, historietas y producciones originales.
Ha trabajado en el desarrollo de la escritura y el diseño de proyectos de animación para empresas como The Jim Henson Company, Stan Winston Studios, Shiny Entertainment, The Walt Disney Company, Warner Bros., Cartoon Network y Nickelodeon.
Munroe comenzó su carrera como artista de guion gráfico en la serie Hey Arnold!
Además escribió la aclamada serie de cómics El Zombo Fantasma, que él mismo creó junto con Dave Wilkins para Dark Horse Comics, y Olympus Heights para IDW Publishing.
Munroe dirigió y produjo una adaptación de imagen real sobre el cómic italiano Dylan Dog, titulada Dylan Dog: Dead of Night, que se estrenó en 2011.