Descubrió la bacteria Salmonella Typhi, causa de la fiebre tifoidea, que en ocasiones se conoce como «bacilo de Eberth».[2] Se doctoró en la Universidad de Wurzburgo en 1859.Fue profesor de Histología y Anatomía Patológica en Zúrich desde 1865 hasta 1881 y posteriormente en Halle.En 1880 describió la bacteria Salmonella Typhi,[3] que identificó en una serie de autopsias de personas fallecidas por fiebre tifoidea.[2] Además, publicó trabajos sobre la difteria, el carbunco, la coagulación sanguínea y los depósitos de amiloide.