Posteriormente, jugó con los Pittsburgh Pirates, Colorado Rockies y Chicago White Sox.En 74 juegos y 280 turnos al bate, bateó 19 jonrones e impulsó 58 carreras.En 2005, varios problemas físicos a inicio de temporada mermaron su desempeño.[3] En 2009, Morneau bateó 30 jonrones, pero una lesión en la espalda lo obligó a perderse la temporada desde el 14 de septiembre, incluyendo la postemporada.[4] En 2010, inició la campaña con buen rendimiento, bateando .345 hasta la pausa del Juego de Estrellas, al cual fue convocado directamente por los fanáticos para ser el primera base titular.Participó en solo 69 juegos, bateando para un bajo promedio de .227 con cuatro jonrones y 30 impulsadas.[10] Finalizó la temporada 2016 con promedio de .261, seis jonrones y 25 impulsadas en 203 turnos al bate.
Morneau bateando para los Mellizos de Minnesota en 2006.
