La primera Junta Municipal de Museos y Bellas Artes fue creada en 1902.
La Junta perdió temporalmente la libertad de actuación durante la dictadura del general Miguel Primo de Rivera, pero una vez instaurada la Segunda República Española recuperó e incluso incrementó su potencial gestor, creando museos especializados, incrementando las colecciones mediante donaciones y adquisiciones como la colección Plandiura, que generó un debate social sobre la compra de arte por parte del estado.
Con algunas de las obras guardadas se realizó una exposición en París (Exposición de Arte Catalán) y el resto se escondieron en territorios neutrales cercanos a la frontera con Francia.
Fue en 1990 cuando se aprobó la ley de museos, que afectaría al área museística.
Durante los últimos años la Junta ha realizado un Plan de Museos y creado diversas propuestas museísticas.