En 1945, cuando Juan Mari Brás tenía 18 años, fundó un movimiento independentista en su escuela secundaria, junto con algunos de sus amigos, en Mayagüez.
En 1944 se matriculó en la Universidad de Puerto Rico.
Finalmente se graduó en leyes en la American University.
En 1946 se convirtió en miembro fundador del Partido Independentista Puertorriqueño (PIP) junto con Gilberto Concepción de Gracia, el mismo año se convirtió en el presidente de la juventud del PIP.
Juan Mari Brás fue el primer ciudadano en recibir la ciudadanía puertorriqueña, un acto sin precedentes que aún hoy es motivo de debate.