Juega como delantero y su equipo actual es Club Deportivo Victoria de la Liga Hondubet.

En 'Ferroválvulas' estuvo tres años, marcó 42 goles, y de allí dio el salto a Boyacá Chicó.

Juan David Pérez se convierte en la esperanza goleadora de Atlético Junior para el presente torneo, luego de que pasara los exámenes médicos y llegara a un acuerdo económico para militar en el club barranquillero por los próximos seis meses.

Con el Junior terminó siendo campeón de la Copa Colombia 2015 al vencer a Independiente Santa Fe 2-1 en el global El grupo inversor que es dueño del pase de Pérez no llegó a un acuerdo con las directivas del Junior, quienes por supuesto quería retener a un jugador que bajo las órdenes de Alexis Mendoza había rendido bien y era útil.

El 16 de febrero le dala victoria a su club por la mínima como visitantes en casa del Atlético San Luis.

El 31 de julio marca su primer gol en la victoria 2 por 0 sobre Santos Laguna por la Copa México.