Márquez hizo todo su proceso formativo en el Deportivo Pereira, club en el que debuta profesionalmente en el año 1999.

Durante 7 temporadas jugaría con un nivel notable, disputando varios partidos de manera ininterrumpida.

En el año 2007 jugó cedido para el Real Cartagena en donde disputó 20 partidos, a la siguiente temporada regresa al Deportivo Pereira.

Culminado su contrato pasaría al Deportivo Pasto donde estuvieron cerca de jugar la final del torneo finalización 2012 aunque fue suplente durante toda la campaña sumando tan solo 4 presencias en cancha.

Para 2014 decide regresar a la actividad profesional y juega por dos años más con el equipo matecaña.