Se casó primero con Micaela Amstrong Gana, pero enviudó joven; con su segunda esposa, Domitila Gana Cruz, tuvo siete hijos: Jorge, Antonio, Domitila, Francisco, Roberto, Victoria y Ana.

[2]​ Sus sobrinos Eduardo Phillips Huneeus y Luis Phillips Huneeus, también se dedicaron a la política.

[3]​ Su primer escaño en la Cámara Baja fue como suplente por Chillán y San Carlos (1861-1864) y en el siguiente periodo, por Ancud, Quinchao y Castro (1864-1867); en 1873, ya como propietario, pasó a representar a La Serena y en 1876 a Elqui, por cuatro legislaturas consecutivas, hasta 1888, cuando fue elegido al Senado por Atacama.

Sucedió a Ignacio Domeyko en 1883 como rector de la Universidad de Chile, mandato que le fue renovado en 1887, pero no alcanzó a terminarlo, pues renunció al año siguiente[1]​ debido a discrepancias con el presidente José Manuel Balmaceda.

[3]​ Su nombre lo llevan un pasaje peatonal que une las calles Catedral y Bandera en Santiago, así como una calle (pasaje) en La Pintana, y varias instituciones, por ejemplo, un colegio en esta última comuna.