Actualmente entrena al Académico de Viseu FC.

Jugador carismático del FC Porto debutó en 1988, se aventuró por primera vez fuera de su país tras haber sido condenado al ostracismo por el técnico Octávio Machado, fichando por el Charlton Athletic.

Regresó en la siguiente temporada, ya con José Mourinho al frente del FC Porto, habiendo formado parte del equipo que ganó la Copa de la UEFA 2002-03, la Liga de Campeones de la UEFA 2003-04 y la Copa Intercontinental 2004.

La llegada de Co Adriaanse al FC Porto, en 2005, marca un nuevo ciclo en su vida, con el entrenador neerlandés dejando claro que no lo consideraba opción para la defensa, y llevando a Jorge Costa por segunda vez a proseguir con su carrera en el extranjero, juntándose a su excompañero del FC Porto y de la selección de Portugal, Sérgio Conceição, en el Standard de Liège, club donde disputó los últimos partidos oficiales.

Llevó al equipo al cuarto puesto en la Liga y a semifinales de la UEFA, siendo destituido en octubre de ese mismo año.