En la primera mitad de la temporada 2014-15, Moya conseguiría nueve goles y su buen rendimiento le permitió volver al Deportivo Saprissa, para tomar un puesto en el grupo absoluto.

Ha disputado dos partidos, incluyendo la Copa Centroamericana de ese año en la que su país se coronó campeón.

Soto confió en él y decidió cambiarle su posición para que fuera delantero centro, para ello debió enseñarle los fundamentos a partir de cero aún con otros jugadores compitiendo como atacantes.

[12]​ Posteriormente, hizo otro gol en la octava fecha del 2 de septiembre, correspondiente al Derby caribeño contra Limón (3-2).

[13]​ Al finalizar la etapa regular, Moya contabilizó catorce partidos efectuados, de los cuales marcó dos tantos, mientras que en cinco oportunidades esperó desde la suplencia y en dos veces no fue convocado.

A finales de febrero salió del país para disputar el torneo internacional IFA Shield, en la India.

En la semifinal del 15 de marzo contra Prayag United en el Kalyani Stadium, Jonathan concretó el tanto del empate transitorio al minuto 27', para llevar la serie a tiempos suplementarios, etapa en la que su club cayó derrotado por 1-2.

Jonathan marcó su primer doblete del certamen a los minutos 8' y 77', para dar la victoria por 1-4.

[33]​ Jonathan terminó el torneo con diecinueve participaciones, con diez tantos concretados y una asistencia.

[56]​[57]​ En la siguiente fecha marcó de cabeza su primer gol como saprissista y el que significó la victoria 1-0 sobre Limón.

[60]​[61]​ Moya logró conseguir su primer doblete con la camiseta morada tras anotarle al Pérez Zeledón en el Estadio Municipal, para la victoria 1-3.

Moya entró como variante por Néstor Monge al minuto 84' y su club empató con cifras de 2-2.

[91]​ Estadísticamente, Moya participó por siete encuentros y en trece veces no apareció en la nómina del director técnico Juan Antonio Anquela.

Con esto, el futbolista regresaría al Deportivo Saprissa, club dueño de su ficha.

Con lo obtenido en la serie, su club perdió la posibilidad de revalidar el título tras quedar eliminados.

[111]​ A pesar de tener la plena confianza del entrenador portugués Guilherme Farinha, la dirigencia saprissista decidió terminar con la cesión del futbolista, para enviarlo en esta misma condición al Zirka Kropyvnytsky de Ucrania, igualmente por una temporada.

[112]​ Tras su llegada a territorio europeo, Moya sumaría su segunda experiencia en el balompié de este continente.

[125]​ Como consecuencia, su pase internacional permaneció bloqueado, quedó sin equipo y carente de salario hasta el final del año deportivo.

[145]​ Hizo su sexto gol del certamen el 10 de diciembre, en la derrota 3-2 ante Pérez Zeledón.

[146]​ Tres días después, vino desde la suplencia en el arranque del segundo tiempo y en cinco minutos marcó la anotación que valió la victoria 1-0 contra Herediano.

[148]​ El delantero contabilizó diecinueve apariciones, hizo siete tantos y colaboró con tres asistencias.

[173]​ Moya contabilizó un total de veinte presencias en este torneo con cinco goles conseguidos.

En tan solo dos días después, anuncia su salida del equipo a través de sus redes sociales donde agradeció al cuerpo técnico que tuvo al frente así como de sus compañeros con quien compartió desde su llegada a los quince años.

[177]​ En este certamen logró afianzarse y cuajar en el equipo, para cumplir con diez anotaciones en veintitrés presentaciones.

En esta ocasión el empate a un tanto prevaleció al término de los 90' minutos, mientras que Moya fue suplente.

Sus compañeros Joel Campbell, Juan Bustos y Rosbin Mayorga anotaron en la victoria de 3-0.

[190]​ Con los resultados obtenidos en esta ronda, su selección logró avanzar como segundo lugar del grupo B.

[193]​ Cuatro días después, Moya marcó el único tanto de su país en la pérdida con goleada 4-1 ante Turquía.

En esta oportunidad, Moya debutó como internacional absoluto tras ingresar de cambio por David Ramírez al minuto 90', y sus compañeros Bryan Ruiz y Juan Bustos concretaron los tantos para la victoria 1-2 para coronar a su grupo campeón por octava vez en su historia.

[215]​ Tres días después entró de variante al minuto 73' por Dylan Flores en la igualada contra Curazao.