Nació en el Reino Unido y se crio en Salem, Virginia.

[6]​ John trabajó como programador por el Instituto de la NASA para Estudios Espaciales en Nueva York desde 1968 a 1970.

En 1978 se incorporó a Computer Sciences Corporation como consultor de software.

Más tarde, mientras estaba empleado por Lockheed en la década de 1980, McAfee recibió una copia del virus Brain y comenzó a desarrollar software para combatir los virus.

Esta compañía se convirtió en Network Associates, un nombre que retuvo durante siete años hasta que pasó a llamarse McAfee, que sigue siendo hoy en día como una de las mayores compañías de seguridad informática y antivirus del mundo.

Añadió que para su propia seguridad tiene gente que compra los equipos por él, utiliza seudónimos para la creación de las computadoras y acceder al sistema, y cambia su dirección IP varias veces al día.

Todos los cargos fueron retirados y McAfee demandó al gobierno de Belice por detención ilegal.

Por su parte, el excanciller guatemalteco, Harold Caballeros, aseguró que en las próximas horas McAfee será entregado a Belice, cuyas autoridades quieren interrogarlo en relación con un asesinato.