Para finalizar, Grant sitió a Pemberton con éxito desde el 25 de mayo en Vicksburg.
Pudieron así abrir el Mississippi al tráfico naval y también partir en dos a la Confederación, lo que la debilitó de forma decisiva.
Cuando la guerra terminó, John C. Pemberton mantuvo una rivalidad con Johnston por la caída de Vicksburg.
Vivió una vida tranquila en una granja en Virginia y luego, desde 1876, él regresó a su estado natal en Pennsylvania.
Allí murió en Penylln y fue enterrado luego en el cementerio Laurel Hill en Filadelfia.