Conocido por ser el máximo representante de lullianismo en Alemania y por haber influenciado con sus obras al compositor Johann Sebastian Bach.
Aun siendo una figura prominente en el desarrollo musical del periodo barroco, de la composición y de la fuga (tanto que, como compositor, era tenido en alta estima por Johann Sebastian Bach).
En 1695 Fischer publicó su primera obra Le Journal du Printemps consistant en airs et balets a 5 parties et les trompettes a plaisir en Augsburgo.
Al año siguiente publicó Les Pieces de Clavessin en Schlakenwerth y en 1702 el Ariadne Musica neo-organoedum en ese mismo lugar.
Primero desarrolla su labor en Schlakenwerth en Bohemia y posteriormente, en 1720, se traslada a Rastatt, donde se presume que permaneció hasta su muerte acaecida el 27 de marzo de 1746.