Se inició como árbitro de fútbol en la temporada 1995/96, de forma fortuita, con tan solo 11 años, ya que su hermano Carlos, cinco años mayor que él, llegó a casa diciendo que quería ser árbitro.

Este era muy tímido y convenció a Jesús para que le acompañara, ya que en su familia nadie había estado relacionado con el mundo del balompié.

Tras su paso por las divisiones regionales del balompié extremeño, ascendió a Tercera División a la corta edad de 17 años, en la temporada 2001/2002, donde estuvo 5 temporadas.

En la categoría de plata del fútbol español arbitró 3 temporadas.

Este curso consistía en potenciar la trayectoria de árbitros jóvenes con proyección internacional.

Convirtiéndose en el segundo árbitro extremeño en hacerlo tras José Luis Pajares Paz.

El 6 de enero de 2018 dirige su primer derbi sevillano, Sevilla CF VS Real Betis Balompié (3-5), jugado en el Estadio Ramón Sánchez Pizjuan.

Convirtiéndose en el segundo árbitro extremeño en hacerlo tras Fernando Carmona Méndez.

El 1 de marzo de 2016 la UEFA anunció que Gil Manzano junto al madrileño Carlos del Cerro Grande formarían parte del equipo arbitral español cómo árbitros asistentes adicionales en la Eurocopa 2016, los otros tres componentes fueron los también madrileños Carlos Velasco Carballo (cómo árbitro principal) y sus dos asistentes habituales en Europa, Roberto Alonso Fernández y Juan Carlos Yuste Jiménez.

El 24 de febrero de 2017 la UEFA anunció que Gil Manzano ha sido elegido para representar a España en la Eurocopa Sub-21 de 2017 que se celebró en Polonia, los otros componentes fueron el también extremeño Ángel Nevado Rodríguez (cómo árbitro asistente 1), Diego Barbero Sevilla, Carlos Del Cerro Grande y Juan Martínez Munuera.