Tras disputar 33 partidos, pese a no conseguir la salvación, Beobide demostró ser un mediocentro de proyección por su despliegue físico.
Inició el año contando con la confianza de Lucas Alcaraz, para posteriormente desparecer tanto del 11 inicial como la convocatoria.
En su vuelta a la Segunda División de España formó una sólida pareja de mediocentros destructivos con Manu García (Excompañero suyo en la Real Sociedad B y el Real Unión), contando para los tres entrenadores que pasaron por el banquillo del Alavés: Natxo González, Juan Carlos Mandiá y Alberto.
Osasuna, pero el Alavés ejecutó una cláusula en el contrato que renovaba a Jagoba Beobide de manera unilateral con el equipo vitoriano.
Su segunda temporada vino marcada por una lesión[2] que le restó bastante protagonismo en el equipo en favor de Dani Toribio.