Actualmente dirige a la selección de Grecia.

[1]​ En la temporada siguiente, fue traspasado al Iraklis Thessaloniki de Grecia, donde jugó hasta su retiro.

Durante su estancia en el Iraklis, Jovanović se transformó en uno de los mejores jugadores extranjeros que han jugado en el club.

Jovanović inició su carrera como entrenador el año 2001 en el Niki Volos F. C. de Grecia.

[9]​El 2 de diciembre del mismo año, fue nuevamente relevado de sus funciones tras un mal comienzo en la UAE Pro League.