Estos pertenecen a las microarquitecturas de Haswell-E y Haswell-EP respectivamente.
Seis puertos SATA, proporcionados por el primer controlador, pueden ser configurados para utilizar Rapid Storage Technology, "RST" (Tecnología de Almacenamiento Veloz) 13.1, la cual soporta niveles RAID 0, 1, 5 y 10.
También es posible utilizar Smart Response Technology, "SRT" (Tecnología de Respuesta Inteligente) para añadir caché a los discos, creando así volúmenes híbridos.
[7] Una Extensible Host Controller Interface, "xHCI" (Interfaz de Anfitrión Controlador Extensible) y dos Advanced Host Controller Interface, "AHCI" (Interfaces de Anfitrión Controlador Mejorada) están directamente integradas en el chipset X99, proporcionando un total de hasta 14 puertos USB.
Cada puerto también tiene la posibilidad de ser habilitado o deshabilitado conforme sea necesario.
[6][1]: 7, 9 [5] Adicionalmente, el chipset cuenta con un controlador Intel Gigabit Ethernet integrado, capaz de manejar, entre otras características, Receive-Side Scaling, "RSS" (Escalamiento del Lado Receptor) y cuenta con dos colas receptoras en hardware.