Esta última se sitúa a los pies, en el lado norte del atrio; es de planta octogonal y consta de cuatro cuerpos separados por impostas, rematados por un casquete bulboso que se añadió en la reforma barroca.

La nave principal se divide en tres tramos y está cubierta por bóvedas góticas de crucería estrellada, cuyos nervios apean en un entablamento barroco con un voluminoso escalonamiento de molduras, sostenido por pilastras adosadas rematadas por capiteles corintios.

Albergó importantes obras de arte como el retablo mayor cuya parte escultórica fue encargada a Damián Forment.

También contó con dos obras del pintor renacentista italiano Tomás Peliguet:[1]​ Jesús ante Caifás y Martirio de dos santos, datadas hacia 1540 .

La iglesia fue ampliada en la segunda mitad del siglo XVIII , posiblemente para adecuarla a la importancia religiosa que adquirió tras los milagros atribuidos a la imagen que albergaba del Santo Cristo durante la guerra de los Segadores.