En 1855, el reverendo Ramón Montsalvatge (enviado por la American Bible Society), llegó a Colombia.
En 1982, la denominación creó el Seminario Presbiteriano de la Gran Colombia para capacitar a sus pastores.
[12] Así, en la década de 1970, la dirección del IPC identificó al Movimiento “La Rosca” como comunista y guerrillero, por lo que sus partidarios como Orlando Fals Borda y otros fueron expulsados de la iglesia.
Por ello, en 1993, los Presbiterios del Sur y Northwest convocó una Reunión Extraordinaria de Unidad, en la que se organizó una nueva denominación, la Iglesia Presbiteriana en Colombia Sínodo Reformado (IPCSR), con estos presbiterios y el CPC.
Mientras tanto, los Presbiterios de Urabá, Central y Costa permanecieron en el IPCol.
En 2000, la Iglesia Reformada Holandesa apoyó la IPCSR en la enseñanza para la formación de pastores, líderes y creyentes en Colombia.