En el siglo XIX, se produjo un despertar intelectual y espiritual en Constantinopla, que empujó a los reformistas al estudio de la Biblia.
Naturalmente, durante estas reuniones, surgían muchas preguntas cuestionando las prácticas y las tradiciones de la Iglesia, las cuales parecían estar en conflicto con los dogmas de la Iglesia.
Los reformistas tuvieron que enfrentarse a una fuerte represión por parte del Patriarcado Armenio de Estambul.
Finalmente, después de que el Patriarca Matteos Chouhajian excomulgara a los reformistas, estos se vieron forzados a organizarse como una comunidad religiosa distinta, el Protestant Millet.
Actualmente, existen iglesias evangélicas armenias en los siguientes países: Argentina, Armenia, Australia, Bélgica, Brasil, Bulgaria, Canadá, Chipre, Egipto, Inglaterra, Francia, Georgia, Grecia, Irán, Líbano, Siria, Turquía, Uruguay y Estados Unidos.