Bakayoko se inició futbolísticamente en el Stade d'Abidjan, de su país, en el año 1995, al año siguiente, como la gran mayoría de sus paisanos, pasó a la liga de Francia, para jugar por el Montpellier, en donde permaneció hasta el año 1999.

La llegada de este jugador causaba gran expectativa en los hinchas ingleses y sobre todo en su técnico, Walter Smith; lamentablemente, pero el marfileño no respondió como se esperaba, y anotó solo 4 tantos en 23 partidos.

Luego de este fracaso, volvió a Francia, esta vez al Olympique de Marseille, club en el que jugó desde la temporada 1999-00, hasta la 2003-04, teniendo muy buenas presentaciones, formando grandes duplas con el belga Jurgen Cavens en la temporada 2002-03, y con brasileño Fernandao en la 2003-04.

La temporada siguiente; es decir, la 2005-06, fue adquirido por el AS Livorno, club toscano de la Serie A de Italia, club en el que permanece hasta hoy.

Durante su carrera, Bakayoko destacó por ser un delantero muy potente y veloz, que podía desdnvolverse tanto por el centro del área como por las puntas; sin ser un delantero muy goleador, siempre ocasionaba peligro y sus piques en corto y sus regates solían ser un dolor de cabeza para las defensas rivales que sufrían por el ritmo vertiginoso y desequlibrante con que jugaba el atacante de los elefantes.