Se reconocen tres especies para este género: H. chungkingensis y H. chowi son del Jurásico Superior; mientras que H. dashanpuensis es del Jurásico Medio.
[2] Hsisouchus chungkingensis fue encontrado en la Formación Shangshaximiao.
[4][2] El holotipo consiste en el esqueleto craneal y osteodermos caudales.
Un espécimen más completo fue hallado y descrito, añadiendo información significativa sobre la anatomía del postcráneo de H.
[2] H. dashanpuensis fue encontrado en la Formación Xiashaximiao.