El equipo disputaba sus partidos como local en el estadio Avanhard y jugó en la Primera Liga de Ucrania hasta la temporada 2015/16.
En 2011 el club agregó el nombre adicional de Hoverla en honor a su montaña más alta.
En 2001 se produjo el debut del Zakarpattia en la Liga Premier de Ucrania, sin embargo, su participación sólo fue de un año, ya que finalizó la temporada en última posición y descendió a la Persha Liha.
El equipo regresó en la temporada 2004-05 y 2007-08, pero el club no pudo evitar el descenso, una vez más después de acabar en el último lugar.
Antes del inicio de la temporada 2011-12 el club cambió su nombre a FC Hoverla-Zakarpattia Uzhhorod,[2] en la que el equipo finalizó en primer puesto y ascendió, nuevamente, a la Liga Premier.