La hipótesis monofilética de la neurona es una hipótesis acerca del origen filogenético de las neuronas, que postula que las neuronas se originaron en un phylum y a partir de ahí fueron evolucionando hacia formas más complejas.
Sin embargo, estudios posteriores demostraron que los ctenofora, que en principio se consideraban estrechamente emparentados con los cnidarios, eran un grupo distinto y filogenéticamente anteriores a los cnidarios.
Actualmente existen argumentos científicos a favor de ambas hipótesis, por lo que el origen de las neuronas todavía no se puede considerar clarificado.
Los argumentos a favor de la hipótesis monofiletica postulan que las neuronas se originaron en los ctenoforos y pasaron a los filos posteriores, pero que por alguna razón acabaron desapareciendo en los placozoos y en los poríferos.
A favor hipótesis polifiletica está la presencia en los cnidarios de determinados genes reguladores de neurotransmisores que no están presentes en los ctenoforos.