[1]​ Estaba situado en la cuenca baja y pantanosa del río Ímbraso, cerca de su desembocadura en el mar.

El templo arcaico tardío del santuario fue el primero de los gigantescos templos jónicos exentos, pero sus predecesores en este lugar se remontan al periodo geométrico del siglo VIII a. C.,,[2]​ o antes.

En el segundo cuarto del siglo VI a. C. se produjo una segunda fase de monumentalización aún mayor, con la construcción del altar monumental, los edificios norte y sur y el templo de Reco.

[11]​ De la doble columnata del templo, solo permanecía en pie a principios del siglo XVIII una sola columna, de la cual derive el nombre Kolonna dado a la localidad.

Anteriormente, se llegaba al santuario por mar y la entrada principal estaba en el lado sureste, cerca de la costa, pero la construcción de la Vía Sagrada llevó a una reorientación del santuario, estando entonces la entrada principal en el lado norte del témenos.

[13]​ Hubo una sucesión de templos monumentales construidos aproximadamente en el mismo lugar al oeste del altar.

[15]​ En el primer templo, el hecatómpedon (1) (4) o templo de los cien pies, se distinguen varias fases constructivas, la primera de las cuales data del siglo VIII a. C..

Se reconstruyó a finales del siglo VII a. C., al mismo tiempo que la construcción de la Vía Sagrada y la Estoa Sur.

Las columnas se alzaban sobre unas inusuales bases en forma de toro que estaban estriadas horizontalmente.

Los cimientos de la columnata periférica y del pronaos no se colocaron hasta el año 500 a. C. aproximadamente.

La construcción continuó en la época romana, pero este templo nunca se terminó del todo.

[12]​ Existen pruebas arqueológicas de actividad en el lugar del altar (7) desde finales del periodo micénico, pero la primera estructura se construyó en el siglo IX a. C. Esta estructura de piedra, tosca y sin decoración, medía 2,5 metros x 1,25 metros.

[5]​ Fue reconstruido siete veces, alcanzando su forma monumental definitiva en el siglo VI a. C., al mismo tiempo que la construcción del templo de Reco, que se construyó en la misma alineación y eje.

Todo el lado oeste consistía en una escalera que conducía a una plataforma plana donde se realizaban los sacrificios, que estaba rodeada por un muro bajo en los lados norte, este y sur.

[27]​ Había una arboleda sagrada al este del altar, que podría haber incluido el árbol sagrado lygos que fue identificado como el lugar de nacimiento de Hera.

Dos filas de columnas sostenían el techo y los muros interiores la dividían en tres secciones iguales.

Fue demolida a mediados del siglo VI a. C. para dar paso al edificio sur.

Aunque tiene la forma de un templo, no parece haber un altar asociado a ella.

Un kuros similar se encontraba junto al templo de Hekatómpedon II; fue destruido a mediados del siglo VI a. C. y solo sobreviven fragmentos.

[33]​[34]​ Un aristócrata llamado Queramies dedicó un grupo formado por un kuros y tres korai hacia el año 560 a .C.

Las esculturas individuales representan a los miembros de la familia del dedicante.

Los análisis paleobotánicos han revelado grandes cantidades de granadas y semillas de amapola en el yacimiento, lo que demuestra que los frutos reales se presentaban efectivamente a la diosa como ofrendas.

Sin embargo, Kyrielis ha argumentado que en realidad se lee (Η)ΡΗ (Hera).

Suelen medir unos 40 centímetros y se han identificado como representaciones abstractas de barcos.

También incluyen objetos exóticos manufacturados, principalmente marfiles de Egipto y Oriente Próximo.

[41]​[30]​ A menor escala, los objetos votivos indican que estos dos fenómenos —interacción con el mundo exterior y uso del santuario para la exhibición competitiva— continuaron en periodos posteriores.

El yacimiento está salpicado de restos de decretos honoríficos y estatuas del periodo helenístico-romano, del tipo que se encuentra en todo el Mediterráneo oriental en este periodo.

Además, se han encontrado en el yacimiento entre seis y trece estatuillas de Isis amamantando a Horus, lo que indica que la conexión o asociación entre Hera e Isis se desarrolló en el periodo helenístico-romano.

[11]​ Las primeras medidas correctas de las estructuras del santuario aparecieron en Antiquities of Jonia, publicado en 1821 por William Gell y Francis Bedford.

[44]​ El interés de los estudiosos creció con algunos descubrimientos casuales como la estatua femenina dedicada a Hera por un tal Cheramyes y exhumada por Paul Girard en 1879 (conocida como Hera de Samos está expuesta en el Museo del Louvre̟, o el kuros dedicado por Leuquios a Apolo, y encontrado en Tigani (la antigua Samos y la actual Pythagoreio)[44]​ La Sociedad Arqueológica Griega dio un impulso decisivo a la investigación del área del Hereo en 1902.