Nacido en Montbéliard, Doubs (Francia), pasó su juventud en Rusia y posiblemente en otras partes de Asia.
A Mouhot se le atribuye popularmente el mérito de descubrir los templos jemeres de Angkor, en Camboya, si bien en realidad fue únicamente la persona que los dio a conocer.
[1] Tanto la Royal Geographical Society como la Zoological Society patrocinaron los viajes de este naturalista, con la intención inicial de catalogar nuevas especies.
El propio Mouhot, incapaz de considerar a los camboyanos capaces de construir tales obras, atribuyó erróneamente los templos a una antigua civilización, que dató en la época del imperio romano.
Mouhot murió por enfermedad en Naphan, (Laos), un año después de su viaje a Angkor.