Es la única estación además de la terminal Grand Central que sirve a las tres líneas al este del río Hudson.
Los trenes salen para la terminal Grand Central, el Bronx y los suburbios en el norte.
La estación Harlem-Calle 125 es rara vez usada para viajes hacia y desde la Grand Central.
La actual estación Harlem-Calle 125 fue construida entre 1896-97 y fue designada por Morgan O'Brien, el principal arquitecto del New York Central and Hudson River Railroad.
Esa estación fue demolida para dar espacio a la mina de cielo abierto.