Guinea Ecuatorial estuvo representada en los Juegos Olímpicos de Seúl 1988 por seis deportistas, cuatro hombres y dos mujeres, que compitieron en atletismo.
[1] El portador de la bandera en la ceremonia de apertura fue el atleta Manuel Rondo.
El equipo olímpico ecuatoguineano no obtuvo ninguna medalla en estos Juegos.
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