Su predecesor inmediato en Nóvgorod, Serguéi, sirvió en el cargo menos de un año, siendo confinado en el Monasterio Chúdov aparentemente debido a una enfermedad mental.
La principal dificultad que encontró Guennadi durante su arzobispado, sin embargo, fue erradicar la herejía judaizante de Nóvgorod y también de Moscú, donde se había difundido cuando varios clérigos novgorodenses fueron transferidos a la capital.
Se dice que imitó los métodos de la Inquisición española, admirando como el rey de España había dirimido con la heterodoxia en su reino, por lo que quemó a varios herejes con el apoyo del gran príncipe y el metropolitano.
[2] La "Cuarta Crónica de Nóvgorod" apunta que Guennadi asimismo ayudó a pagar un tercio de la reconstrucción del actual Detinets entre 1484 y 1490,[3] y en 1492, calculó cuando sería la Pascua para los siguientes mil años.
Esto tendría grandes consecuencias, no sólo en la realización de los rituales religiosos, sino también en cuando plantar o cosechar, por lo que podría haber conducido potencialmente a la población a la hambruna.