[1] Este taxón fue descrito originalmente en el año 1901 por el zoólogo estadounidense Joel Asaph Allen, bajo el nombre científico de Phyllotis chacoënsis.
[2] Etimológicamente el término específico es un topónimo que refiere a la patria de origen del ejemplar tipo: la región chaqueña.
Los 3 ejemplares capturados en Waikthlatingwvayalwa y que sirvieron para su descripción respondían a las mismas características externas, incluyendo el pelaje ventral completamente blanco.
[7][8][9][10] G. medius había sido sinonimizado con G. griseoflavus y en 2007 con G. centralis y, como hipótesis, que G. medius y G. centralis serían sinónimos de G. chacoensis,[11] la cual había sido considerada una especie válida por M. Díaz en 1999 al examinar su ejemplar tipo,[12] si bien en 2007 la transfirió a G. griseoflavus como una subespecie.
[5] Esta especie habita en zonas arbustivas y boscosas semiáridas a húmedas en el oeste del Paraguay sudeste de Bolivia y el norte de la Argentina, en la región del chaco.