Tras realizar las divisiones inferiores en Acassuso se incorporó en 2001 a Platense, donde debutó y jugó hasta 2005.

Su primer gol con la camiseta blanca y marrón fue en el Clásico de la Zona Norte.

Su último gol en Argentina fue en la primera fecha del Apertura 2009, frente a Atlético Tucumán.

El 13 de septiembre debuta en el club francés, fue titular contra el Stade Rennais en la caída 1 a 0.

El 19 de septiembre marca su primer gol por Ligue 1 contra AJ Auxerre en el empate 1 a 1.

En el Torneo Apertura 2015, Gonzalo es titular en 13 encuentros, mientras que sustituye a un compañero en 2 oportunidades, y marca 1 gol.

[3]​ Su debut se produjo el 17 de septiembre en una victoria por 2-1 frente a Vélez Sarsfield en donde asistiría en el segundo gol.

El destacado delantero, también logró ser campeón con Nacional en 8 ocasiones, ganándose el cariño de la hinchada.

En la entidad uruguaya, logró 8 títulos: En la temporada 2020 tuvo un rendimiento superlativo, siendo distinguido por la encuesta Futbolx100, organizada por el suplemento Referí del diario El Observador, como Mejor Jugador del Campeonato Uruguayo 2020, mejor delantero, mejor extranjero e integrante del equipo ideal de la temporada, además de tener el mejor año en toda su carrera hablando de registros, siendo el goleador de la temporada con 25 tantos y logrando así, superar a Richard "Chengue" Morales como máximo goleador del siglo XXI en el club.

Sumado a esto sufrió una grave lesión que le impidió formar parte del equipo durante unos meses.