La misión se complica cuando Trevelyan es capturado y asesinado por el general Arkady Ourumov.

Bond destruye la base detonando las cargas explosivas colocadas con anterioridad y consigue escapar en avión.

En su huida de la base Bond conoce a Natalya Simonova, técnico del GoldenEye, y ambos son capturados por el ejército ruso y llevados a los archivos militares en San Petersburgo como culpables del incidente de Severnaya.

Trevelyan logra escapar de Bond y captura a Natalya, ahora una figura clave para su plan.

[1] Solo el personaje de M está interpretado por la misma actriz en la película original y el videojuego.

Los niveles han sido rediseñados para reflejar la historia modificada y el juego incluye elementos jugables modernos, tales como escenarios interactivos, entornos destructibles, combate cuerpo a cuerpo, quick time event, salud regenerativa y modo multijugador en línea.

El juego es compatible con todas las opciones de control que ofrece la consola Wii.

La primera de las opciones, además del uso del Wii Remote para apuntar a la pantalla, permite al jugador asomarse detrás de una cobertura, ejecutar golpes cuerpo a cuerpo, reducir enemigos silenciosamente y superar distintos obstáculos moviendo el Wii Remote y el Nunchuk de diferentes maneras.

Si los objetivos adicionales no se completan el juego aún permite avanzar en la historia pero solo en el modo de dificultad más bajo.

Para Wii se comercializó la edición estándar y la edición especial, GoldenEye 007 Classic Edition, que incluía una copia del juego, una versión dorada del Wii Classic Controller Pro y un código para desbloquear el modo multijugador en línea "conflicto clásico" (que normalmente esta bloqueado hasta el nivel 35).

La consola de Sony recibió un pack especial, GoldenEye 007: Reloaded – Double 'O' Edition, que incluía una copia del juego, acceso al personaje descargable Hugo Drax, el PlayStation Move Motion Controller y Navigation Controller, la cámara PlayStation Eye y el periférico Sharp Shooter.