Los genes homeobox codifican proteínas que actúan como factores de transcripción de otros genes que dirigen el desarrollo de los distintos segmentos corporales e indican qué clase de estructuras deben desarrollar (por ejemplo, antenas en la cabeza y patas en los tres segmentos torácicos, como se aprecia en las moscas Drosophila mutantes para estos genes).
En los genomas de ratones y de seres humanos también se encontraron genes homeobox casi idénticos.
Un ejemplo importante del gen Homeobox es DBX1 que codifica para la proteína DBX1, también conocida como la proteína homeobox cerebral en desarrollo 1.
Los interneurones espinales V0 y V1 se derivan de dominios progenitores que se diferencian por la expresión de proteínas homeodominio DBX1 y DBX2.
La familia de genes homeóticos en vertebrados puede dividirse en dos sub-familias: