Günter Seibold debutó en 1958 a los 22 años de edad con el SpVgg Cannstatt, equipo de su ciudad natal.
Al finalizar la temporada, Günter fichó por el VfB Stuttgart, club en el que jugó un total de 255 partidos en los que marcó 10 goles durante las once temporadas que permaneció en el equipo alemán.
En 1969 dejó el club y a los pocos días el SpVgg 07 Ludwigsburg se hizo con el servicio del jugador.
Tras su retiro fichó por el SV Rehnenhof como nuevo entrenador.
Tras los malos resultados el club cesó a Günter de su cargo.