A partir de la temporada 2024-25, disputa la Serie B, que es el segundo nivel del fútbol de Italia.
En 1990, después de ascender con mucho sufrimiento a la Serie C1, el club fue cancelado por problemas financieros y después de ser refundado, comenzó a jugar en la Serie D. En 1994, aunque no quedó en zona de ascenso la FIGC le dejó entrar en la C2 porque había sobrado una vacante.
En 2003 Maurizio Stripe comprò el club y al año siguiente ascendió a la C1.
En 2005 Frosinone perdió los playoff para entrar en la B pero al año siguiente finalizó segundo en la tabla, solo después del Napoli.
Así pudo ascender a la B y en su primer año en esa categorìa, el club compró jugadores de renombre como come Massimo Margiotta, Francesco Lodi, Francesco Carbone, Juriy Cannarsa, Lucas Rimoldi, Fabio Di Venanzio y Andrea Mengoni.