De joven, fue oficial del ejército, luego hizo una carrera académica en geología y biología.

Al mismo tiempo, fue nombrado conferenciante en geología en la Universidad de Otago y curador del museo allí junto con Emile Campbell-Browne (1830–1925).

Le fue otorgado la Medalla Clarke por la Real Sociedad de Nueva Gales del Sur en 1891.

Se lo conmemora en el Hutton Memorial Medal and Research Fund, otorgado para trabajos científicos en zoología, botánica o geología de Nueva Zelanda.

Y le fueron puestos epónimos en su honor a Puffinus huttoni, un ave de mar.