Francisco S. Rivera fue un marino argentino que sirvió en la armada de su nación a fines del siglo XIX.
Integró la tercera promoción 3 de la Escuela Naval.
Fue luego presidente (1886) y vicepresidente 1.º (1890) de dicha entidad.
En 1891, con el grado de capitán de fragata, fue puesto al mando del ariete torpedero Maipú.
Tras permanecer buena parte del año fondeado como pontón frente a Punta Indio se sumó a la escuadra interviniendo en la revista naval del 3 de septiembre de ese año.