[3]​ Inició su carrera profesional jugando cinco encuentros con los Mahoning Valley Scrappers durante la temporada 2011.

[9]​ Debutó ese mismo día como bateador emergente, donde también logró conectar su primer hit.

[11]​ Finalizó la temporada 2015 con .313 de promedio, 12 jonrones, 51 impulsadas, 12 bases robadas y 22 dobles en 99 juegos con los Indios.

En 2016, Lindor finalizó la temporada con .301 de promedio, 15 jonrones, 78 impulsadas, 19 bases robadas y 30 dobles en 158 juegos.

[12]​ Al finalizar la temporada, fue galardonado con el Guante de Oro como campocorto en la Liga Americana, el primero en su carrera.