Es el jugador con más partidos en la historia del neroverdi hasta el día de hoy.
A lo largo de su carrera en el club, Magnanelli ha jugado para varios equipos italianos: comenzó su carrera con Gubbio en el 2000, y luego jugó para Chievo Verona, Fiorentina y Sangiovannese, antes de unirse al Sassuolo en 2005, donde ayudó al equipo a promocionar desde la Serie C2 a la Serie A; ganó los títulos de la Serie C1 y la Serie B con el club en 2008 y 2013, respectivamente, y más tarde fue nombrado capitán del equipo.
El 22 de mayo de 2022 disputó su último partido en la derrota ante el A. C. Milan y anunció su retiro luego de estar 17 años y jugar 520 partidos disputados con el Sassuolo.
[3] Magnanelli ha sido descrito como un centrocampista talentoso, decidido, humilde y trabajador.
Él generalmente se despliega en el centro, y es conocido en particular por su liderazgo y rango de pases, así como su conciencia táctica, y la lectura del juego, además de su tenacidad, y la capacidad de recuperar la posesión o interceptar pases como un mediocampista defensivo.