Fort Winnebago es un pueblo ubicado en el condado de Columbia en el estado estadounidense de Wisconsin.

[2]​ Fort Winnebago se encuentra ubicado en las coordenadas 43°36′31″N 89°25′23″O / 43.60861, -89.42306.

Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, Fort Winnebago tiene una superficie total de 86.46 km², de la cual 83.29 km² corresponden a tierra firme y (3.67%) 3.18 km² es agua.

[3]​ Según el censo de 2010,[4]​ había 825 personas residiendo en Fort Winnebago.

De los 825 habitantes, Fort Winnebago estaba compuesto por el 98.67% blancos, el 0.36% eran afroamericanos, el 0.36% eran amerindios, el 0% eran asiáticos, el 0.24% eran isleños del Pacífico, el 0% eran de otras razas y el 0.36% pertenecían a dos o más razas.