Flávio Ferreira se formó en la cantera del Académica de Coimbra.
Jugador joven y prometedor, con el propósito de madurar como futbolista, fue cedido en 2009 al GD Tourizense.
Por aquel entonces el club se encontraba en la Tercera División de Portugal, donde hizo una buena temporada marcando 3 goles.
En esta etapa el jugador destacó y demostró una excelente visión de juego, ayudando al equipo a mantener la categoría.
[2] Sin embargo, en junio de 2013, el Málaga CF le fichó para las tres próximas temporadas, más una cuarta opcional.