La Final de Ascenso 1998-99 fue una llave de definición en la cual se enfrentó el campeón del Torneo Invierno 1998: Atlético Yucatán, contra el campeón del Torneo Verano 1999: Unión de Curtidores, disputándose en partidos de ida y vuelta, para determinar al equipo que ascendería a la Primera División.

Disputarán el ascenso a la Primera División los campeones de los Torneos Invierno 1998 y Verano 1999.

Si al término del tiempo reglamentario el partido está empatado, se agregarán dos tiempos extras de 15 minutos cada uno.

De persistir el empate en estos periodos, se procederá a lanzar tiros penales, hasta que resulte un vencedor.

Si el Club vencedor es el mismo en los dos Torneos, se producirá el ascenso automáticamente.