Nacido en Bérgamo, Perucchini comenzó con el equipo italiano Albinoleffe, antes de unirse al Milan en 2002.
Para ganar experiencia en el primer equipo, Perucchini fue cedido al Fano de la Lega Pro Seconda Divisione para la temporada 2010-11.
El 26 de septiembre, también hizo su debut en la liga, reemplazando a Alessandro Beni en la segunda mitad del partido en casa contra San Marino.
En julio de 2015 regresó a Lecce y jugó 27 partidos en la Serie C con el club en la temporada 2015-16.
En el verano de 2017, el préstamo se renovó por otra temporada, en la que Perucchini y sus compañeros consiguieron el ascenso a la Serie B.