Es un organismo privado sin ánimo de lucro que cumple funciones de interés público y social, siendo parte activa del sistema nacional del deporte.

Está afiliada a la Federación Internacional de Natación, la Confederación Sudamericana de Natación y el Comité Olímpico Colombiano.

De igual manera se encarga de la organización del polo acuático, nado sincronizado y los clavados en Colombia.

La Gobernación del Valle del Cauca le otorgó igualmente personería jurídica el 6 de septiembre de 1973 según la resolución n.º 3387.

En la actualidad a la Federación la conforman 21 Ligas afiliadas de igual número de departamentos quienes tienen registrados en esta entidad aproximadamente 3.850 deportistas en todas las modalidades que gobierna este organismo; Natación Carreras, Clavados, Polo Acuático, Nado Sincronizado, Aguas Abiertas y Natación Máster.